Le projet s’inscrit dans la politique nationale d’amélioration du cadre vie des populations à travers la sécurisation et l’amélioration de l’environnement urbain du Togo.
 
Financée par des partenaires en développement notamment l’Agence Française de Développement (AFD) et l’Union Européenne (UE),  cette deuxième phase du PAUT concerne la réalisation d’un quatrième Lac de 40 hectares servant de bassin tampon de stockage des eaux de ruissellement, la construction d’un dispositif d’acheminement de ces eaux et celle du lac Est de la ville de Lomé vers la mer, la construction d’une grande décharge à Akodésséwa et enfin l’assainissement des quartiers périphériques de Lomé. 
 
Cette seconde phase du PAUT contribuera à l’assainissement global de la ville de Lomé et permettra de juguler les problèmes récurrents d’inondation qui affectent les riverains des zones lagunaire et portuaire pendant les périodes de pluie et, à l’élaboration des plans directeurs d’assainissement (PDA) des cinq chefs-lieux des régions économiques du Togo.
 
Le coût total du projet est estimé à 43 millions d’euros.  La durée d’exécution s’étale sur 6 ans.

D’autres projets ont été réalisés dans ce sens.

Il s’agit entre autre du Projet Environnement Urbain  du Togo (PEUL) financé par l’Agence Française de Développement en 2009, qui a permis le dragage  du lac Est et le grand canal d’équilibre, le Projet d’Aménagement de la Zone Lagunaire (PAZOL) pour le dragage du Lac de Bè et  le Projet d’urgence de réhabilitation des infrastructures urbaines et des services électriques de Lomé (PURISE).